Le mieux, à mon avis, serait de prendre conseil auprès d'un vétérinaire spécialisé. L'aviculture étant développée bien plus en Alsace que de par chez nous, par exemple, il doit y en avoir un paquet :)
Par exemple, pour Paracox, si je ne me trompe pas, il suffit d'une seule dose, le 1er ou le 3ème jour de vie : http://s355685463.onlinehome.fr/detail_medicament.php?id=305
Après, la coccidiose se traite assez bien sur les poussins, il faut toujours avoir sous la main BayCox ou équivalent.